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OvineSNP50 BeadChip阵列特有超过54,241个靶向SNP的均匀间隔探针,为全基因组关联研究及其他应用(如全基因组选择、遗传优势的确定、数量性状位点的鉴定,以及比较遗传学研究)提供了更充足的SNP密度。
该BeadChip由公司携手International Sheep Genomics Consortium的AgResearch、Baylor UCSC、CSIRO和USDA的主要绵羊研究人员共同开发。该阵列特有超过54,241个靶向单核苷酸多态性(SNP)的均匀间隔探针。借助Illumina Genome Analyzer IIx,通过测序简化文库发现了其中超过18,000个标记。使用BAC端测序从23个品种的403只动物中识别了一组SNP(600个),并采用Illumina GoldenGate Genotyping Assay对这些SNP进行验证。其余SNP来源于绵羊基因组草图。
凭借大约每46kb一个标记,OvineSNP50 BeadChip可实现全基因组的均匀覆盖。该BeadChip由Infinium HD Assay提供技术支持,并可提供业界*高的检出率,可进行灵活的内容部署并能检测和测量拷贝数变异。
该BeadChip可通过允许研究人员同时检测多达12个样本,进一步降低实验差异性
该分析的单管样本制备(无PCR或连接步骤)可显著减少人力和潜在的样本处理错误