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离子交换根据蛋白表面电荷的不同分离蛋白。根据带电荷的蛋白和层析填料上相反电荷之间的可逆相互作用进行分离。上样时,蛋白和层析柱结合。然后改变条件,结合的组分分别被洗脱下来。通常提高盐浓度或改变pH进行洗脱。*常用盐(NaCl)梯度洗脱,目标蛋白在和填料结合时被浓缩,然后收集到纯的组分里。