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技术特点
(1)操作简单、快速、通量高
单个微生物菌落或其它生物材料经简单的样品前处理后,使用MALDI-TOF质谱仪进行测定。所获得的 质谱图可直接送到 Biotyper数据库进行检索。这个简单而独特的工作流程可以满足绝大多数微生物的鉴定,而且不需要进行革兰氏染色、氧化酶试验或选择PCR引物。一个 样品从获得单克隆开始,到样品处理、谱图采集和获得鉴定结果可以在几分钟内完成,操作简单、快速,通量高。
(2)灵敏度高
使用经久耐用且性能可靠的布鲁克·道尔顿的MALDI-TOF系列质谱仪,可以实现高重现性的快速可靠检测。由于仪器的高灵敏度,可以检测到低至5000个细胞。
(3)准确度好
MALDI-TOF获得的蛋白指纹图谱用作模式匹配,匹配分值用作鉴定结果的分级和归类。Biotyper软件对所得的图谱进行归一化分析,其精巧的算法保证了鉴定的精确性。蛋白指纹图主要集中在2-20kDa受到微生物生长环境和状态影响很小的稳定高表达的那些蛋白。
(4) 开放式的Biotyper微生物蛋白特征指纹图谱数据库系统。
MALDI Biotyper高通量微生物鉴定系统的另一个重要组成部分是Biotyper微生物蛋白特征指纹图谱数据库系统。这一数据库系统采用开放式的设计,使用 简单,占用资源少,使用服务器和客户端架构,既可使用专用的电脑服务器,也可以单机使用,方便、快捷地大批量地处理数据,无需专人维护。目前数据库中已经 含有常见的近4000种微生物的特征指纹图谱,而且还在不断增加中。此外,用户可以根据自己的需要,轻松地添加所获得的新的微生物特征指纹图谱,并用于日常检测、鉴定工作中。
(5) 大量实际应用经验积累
MALDI Biotyper高通量微生物鉴定系统的开发过程中得到了诸如德国微生物和细胞培养收集中心、美国农业部农业研究服务中心食品微生物学部及其他众多欧美政 府部门和大学、医院、研究所等科研单位的支持,在多方合作的努力下,积累了大量实际应用经验,并且这一系统已经在这些地方得到了充分地应用。专家们一致认 为MALDI Biotyper具有快速简便的工作流程和强大可靠的数据处理能力,是微生物鉴别与分类中的*新技术。现在已有多个国家将这一方法应用于临床样品的常规检 测。
(6)在中国食品安全等领域中的应用
近几年相继发生的几起食品安全事件,引起人们对食品安全问题的广泛关注。我国监管部门也越发加强了对食品安全问题的重视。如2008年12月29日发布、 2009年4月1日开始实施的新国标GB/T 8538-2008《饮用天然矿泉水检验方法》,就提高了对饮用水的检测要求,要求对饮用天然矿泉水及其灌装水进行粪链球菌、铜绿假单胞菌和产气荚膜梭菌 等3项微生物指标的检验。而Biotyper数据库中已经有这些菌的标准图谱,可以很方便地进行这些菌的检测,可以用于自来水和其它饮用水中的微生物鉴定。