不同种属的细菌具有不完全相同的生化特征。细菌测定系统的原理本系统选取21种典型生化试验，并把生化反应的结果转换为一个8进制数，通过提供的标准数据库查询系统可得到实验菌株归属的相对概率、T值和R值，对菌株的归属进行一定程度的鉴定。
将细菌各项生化反应结果填入附赠的记录卡中，细菌测定系统的原理依次每三项为一组，若这三项反应均为阳性，则分别记为1、2、4，若为阴性，则相应项记为0。将每组三项的数值相加，共七组，组成一个七位数。
将所得七位数输入数据库系统中即可进行查询。细菌测定系统的原理若某项生化反应结果较难判断，则按照阴性进行记录，但查询时，应在不定的生化反应前打钩。这样，即使是不确定生化同样可以做出鉴定结果。 经过反复试验校正，该实验准确率大大提高，同时系统的准确率接近100%，大大缩短了生化鉴定的时间，提高了鉴定效率。
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